随着北京疏解非首都功能、“无煤化”改造及大兴区火灾引发的大排查，马各庄也成为“空村”，其多年形成的产业生态瓦解殆尽。

时村乡黑作坊老板赵某说，河间驴肉火烧的名声打出去之后，全国各地都有了驴肉火烧店，从这以后，很多店铺就开始用猪肉、骡子肉、马肉来假冒了。

《浙江:骚扰电话挤占 110总接警量超四成为无效警情》因马各庄外来人口聚集，部分地区存在房屋陈旧等现象。2016年3月，该村被北京市政府列为“2016年棚户区改造和环境整治任务”的储备项目，待棚改审批通过后即启动。2017年4月，北京市确定城六区实现“无煤化”，马各庄等522个村进行“无煤化”改造，《北京日报》援引村党总支书记刘福新的话称，马各庄村947户居民响应“无煤化”改造，只用了46天完成了临时周转，10月底村民就搬到村域外居住。