不服一审判决，王新海提起上诉，他认为，采用签外协报劳务费是以变通方法解决报销在研究、实验中产生的相关费用，是为了科研顺利运行。一审判决事实不清，量刑过重。

他也不忘替自己辩解，“若涉及主权或民族感情问题，则不必刻意去刺激，我们就是坚守立场，表达异议或是抗议;大家以为我们没有，但是其实都有。”该言论遭到台湾网友的口诛笔伐，有网友称，“从来没见过你的抗议”，“简直就是卖国贼”。

《人民日报署名文章：事实胜于雄辩》美国国防部长马蒂斯2017年初访日时表示“钓鱼岛适用‘日美安保条约’”，而面对钓鱼岛被蚕食鲸吞，蔡英文和“驻日代表”谢长廷均未对此作出表态，引发岛内批评两人是“儿皇帝”“孙代表”。